新皇崗口岸今年落成，仍是港深唯一的二十四小時通關的口岸，並將以「合作查驗、一次放行」模式，預料通關時間由半小時縮短至五分鐘，將成為港深通勤、交通的樞紐。新皇崗口岸接駁五條港深地鐵線路，應增設更多的交通線路，以接駁關口與香港市中心，真正實現「港深同城化」的「一小時生活圈」。
皇崗口岸重建經年，由二零一九年至今，將在今年落成，重建後的新皇崗口岸仍是港深唯一二十四小時通關的口岸，並將以「合作查驗、一次放行」模式，免卻長期的「兩地兩檢」、分別在深圳和香港兩次過關查驗的繁複程序，可實現「一證通關」，預料通關時間由半小時縮短至五分鐘，將成為港深通勤、交通的樞紐。新皇崗口岸將接駁五條港深地鐵線路，但亦應增設更多巴士、小巴線路，以接駁關口與香港市中心交通，真正實現「港深同城化」的「一小時生活圈」。
近日，媒體多次報道新皇崗口岸大樓主體建設基本完工，預料口岸也將在七月啟用。三月二十七日，香港保安局局長鄧炳強在立法會保安事務相關會議上表示「口岸必然會在本屆政府任期內啟用」，並強調「當局希望可以提早，但具體可以提早的時間，仍要視乎建築及裝修進度，以及法例通過情況」。
根據會後以立法會保安委員會名義公布的「皇崗口岸重建項目的最新發展及落實『一地兩檢』安排的立法建議」來看，相關立法程序也正在快速推進。與此同時，深圳市政府也開始了相關通關設備的招標，建築建設已然步入尾聲。可見，新皇崗口岸距離投入使用已然不遠。
在客運功能上，新皇崗口岸與原皇崗口岸的作用一致，都是基於公路運輸的陸路幹線口岸。但在原有基礎上，增加了俗稱「兩地一檢」，即「合作查驗、一次放行」的功能。新皇崗口岸的通關流程將與已經投入使用的珠澳「橫琴口岸」類似，可以通過「一台閘機、兩道閘門」的形式，將原來三十分鐘的通關過程縮減至五分鐘。因此，原本用於接駁皇崗口岸至落馬洲檢查站的「皇巴士」也將終止運營。
通關效率提升，有利於兩地居民的往還。同時，亦需要加強口岸與香港市中心的巴士、小巴聯通，以促進深港通勤更加方便，真正實現「一小時生活圈」。
根據香港運輸署向沙田區議會提交的檔案來看，目前新增四條及延伸三條的日間及通宵巴士及小巴路線，伸延至新皇崗口岸，又或在原有路線上提供特別班次服務。
其中，城巴第976A號線（新田公共運輸交匯處│小西灣（藍灣半島）、九巴第N73號線（新田公共運輸交匯處│沙田巿中心）將把總站延伸至新皇崗口岸，976A並由現時只於繁忙時段服務提升至全日服務。九巴第276B號線（天富│上水（彩園）則增設特別班次，往來皇崗口岸至天富巴士總站。並在此基礎上，建議增設皇崗口岸│葵翠公共運輸交匯處、皇崗口岸│啟德（世運道）經中九龍幹線、皇崗口岸│烏溪沙站公共運輸交匯處、皇崗口岸│青山灣巴士總站（節假日服務）四條路線。另有包括78、44B、44B1、N44B、79S、616S等小巴路線也延伸至新皇崗口岸。
以上線路整體而言都是自皇崗口岸向西南前往元朗、屯門或向東南前往大埔，各自只有一條線路途經荃灣和沙田，離皇崗口岸最近的北區甚至一條途經線路都沒有。新界北立法會議員姚銘甚至因此於四月八日致函運輸署詢問。
當局指署方亦正和相關營辦商研究優化及加強服務，包括調整行車路線及服務範圍，以進一步便利旅客利用跨境巴士服務往返新口岸。新皇崗口岸除了便利旅客往返，作為唯一二十四小時通關口岸肩負著「一小時生活圈」大動脈的功能，目的也在於便利港深通勤，目前深圳接駁新皇崗口岸的交通較充分，香港在北環線未開通前，就只能依靠巴士、小巴，當局宜在配合「北部都會區」規劃的前提下，增加更多接駁口岸與港島、九龍的巴士、小巴線路。
長遠而言，隨著北環線的開通，北都大學教育城以及北部都會區、落實「北創科、南金融」的格局，深港通勤主要的方向則會轉變成香港北都以及深圳各口岸，屆時交通格局將會劇變，而交通線路就會再度調整。惟發展北都是數以十年的大計，過渡期安排不容忽視。
新皇崗口岸的開通受到萬眾期待，自然的就有對「一次放行」的期盼，對比深圳推出了公鐵複合、高效換乘的計劃，香港的發展則稍嫌落後，但這源於過去香港對北部邊境開發不足，並非短時間可以解決。當今宜針對短期、中期，制訂不同交通方案，以滿足兩地居民的港深交通、通勤需求，短期內應加強巴士、小巴的班次與站點，以期接駁到市中心。